Jmol-Wiki-Extension: Unterschied zwischen den Versionen

Aus Chemie digital
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Version vom 2. April 2013, 14:17 Uhr

In diesem Artikel wird beschrieben wie die Jmol-Extension für die Wiki-Software verwendet werden kann.

Man kann damit zum Beispiel cml-Dateien dynamisch hier auf einer Wiki-Seite anzeigen, und das Molekül von allen Seiten betrachten. Hochgeladene CML-Dateien sind hier im Wiki in der Kategorie Kategorie:CML-Datei

Einfache Anwendung

Ein Beispiel:

       

Um die Zeichnung links zu erhalten, muss man folgendes im Code stehen haben:

<jmol>
 <jmolApplet>
  <size>300</size>
  <uploadedFileContents>CisDecen.cml</uploadedFileContents>
 </jmolApplet>
</jmol>

Bisher gibt es nur die Möglichkeit quadratische Zeichnungen einzubinden. Und bei diesem Aufruf wird immer die Voreinstellung zur Darstellung verwendet, nämlich ein Kugel-Stab-Modell.

Per Rechtsklick kann man aber über das Kontext-Menü viele Änderungen vornehmen.

Um ein anderes Molekül darzustellen, zeichnen Sie es in einem Programm wie Avogadro, speichern es als cml-Datei ab, laden es hier hoch und tragen dann den Namen der Datei ein. Im Beispiel-Code für dieses Beispiel müssen Sie also CisDecen.cml ersetzen.

Skripting

Um die Darstellung im Jmol-Bild zu verändern, oder per Knopf eine Änderung der Darstellung zu ermöglichen, kann Skripting genutzt werden.

FEHLT LEIDER NOCH! Wer Zeit hat, kann auf den Seiten der Extension und auf dem Jmol-Wiki mal nachschauen und ein paar Informationen dazu heraussuchen.

Weitere Informationen auf dem Jmol-Wiki