Jmol-Wiki-Extension

Aus Chemie digital
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In diesem Artikel wird beschrieben wie die Jmol-Extension für die Wiki-Software verwendet werden kann.

Man kann damit zum Beispiel cml-Dateien dynamisch hier auf einer Wiki-Seite anzeigen, und das Molekül von allen Seiten betrachten. Hochgeladene CML-Dateien sind hier im Wiki in der Kategorie Kategorie:CML-Datei

Einfache Anwendung

Ein Beispiel:

       

Um die Zeichnung rechts zu erhalten, muss man folgendes im Code stehen haben:

<jmol>
 <jmolApplet>
  <size>300</size>
  <uploadedFileContents>CisDecen.cml</uploadedFileContents>
 </jmolApplet>
</jmol>

Bisher gibt es nur die Möglichkeit quadratische Zeichnungen einzubinden. Und bei diesem Aufruf wird immer die Voreinstellung zur Darstellung verwendet, nämlich ein Kugel-Stab-Modell.

Um ein anderes Molekül darzustellen, zeichnen Sie es in einem Programm wie Avogadro, speichern es als cml-Datei ab, laden es hier hoch und tragen dann den Namen der Datei ein. Im Beispiel-Code für dieses Beispiel müssen Sie also CisDecen.cml ersetzen.

Skripting

Weitere Informationen auf dem Jmol-Wiki