Avogadro

Avogadro ist ein Molekül-Editor für den plattformübergreifenden Einsatz in Computer-Chemistry, Molecular Modelling, Bioinformatik, Materialwissenschaften und verwandte Gebiete. Es handelt sich um ein reines Community-Projekt, hinter dem keine Firma steht und es ist ein Open Source-Programm.

Man hat versucht einen einfachen, intuitiv zu bedienenden Editor zu schaffen, in dem man auch typische Molekül-Fragemente nutzen kann, die man direkt von PDB oder PubChem herunterladen kann. Es gibt eine Automatische Optimierung, die gleichzeitig die Bearbeitung erlaubt. Es wird flexibles und qualitativ hochwertiges Rendering und eine leistungsstarke Plugin-Architektur geboten, wodurch es viele Darstellungsarten gibt.

Durch die Verwendung des CML-Dateiformat als natives Dokumententyp versucht Avogadro eine gute Zusammenarbeit mit anderen Programmen zu ermöglichen.

Avogadro ist inzwischen in mehr als 19 Sprachen verfügbar.

Homepage und Download

Homepage: Wiki-Startseite

Installation:

• In den meisten Linux-Distributionen ist Avogadro bereits enthalten oder kann über die Software-Verwaltung installiert werden.
• Windows und Mac-Besitzer finden hier die Installations-Dateien.

Film-Tutorials

Vorstellung von Avogadro (1)	Vorstellung von Avogadro (2)
Im ersten Teil der Reihe wird gezeigt, wie man in Avogadro Moleküle zeichnet, diese von verschiedenen Seite betrachten kann und bearbeitet.	Es wird gezeigt, wie man Benzol zeichnen kann. Zwischendurch wird bei Cyclohexan gezeigt, dass man verschiedene Konformere zeichnen kann. Und dann werden verschiedene Darstellungsarten gezeigt, wie auch eine Art Kalottenmodell.

Anleitungen für Schüler zur Benutzung

• Benutzung von Avogadro zur Untersuchung der Polarität bei Essigsäure